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按照知网查重的算法，参考文献格式不正确，知网是直接安排正文内容查重，故会出现将参考文献纳入查重率中。 正确的参考文献格式应是如此： 在论文中的引用处以右上标 (小四宋体)加方括号的方式表示，不得标注在各级标题之上。
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封面、摘要、绪论、第一章、第二章、等等这样一系列的都会各自分成一个片段来检测，每一个片段都计算出一个相似度，再通过这样每章的相似度来计算出整篇论文的总重复率。 当知网查重系统识别到你论文中有某句话涉嫌抄袭的时候，它就会对这句话的前面后面部分都重点进行模糊识别，这个时候判断标准就变得更严格，仅仅加一些副词或虚词 (比如“的”、“然后”、“但是”、“所以”此类词语）是能够识别出来的。 在知网查重进行中，检测系统只能识别文字部分，论文中的图片、word域代码、mathtype编辑的公式、是不检测的，因为检测系统尚无法识别这些复杂的内容格式。