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关于JCR(Journal Citation Reports, 期刊引证报告) 期刊分区影响较为广泛的有两种：一种是 Thomson Reuters 公司制定的分区（中文一般翻译为汤森路透分区）；第二种是中国科学院国家科学图书馆制定的分区（简称中科院分区）。这两种分区方式均基于 SCI 收录期刊影响因子基础之上进行分区的。
1.1 汤森路透分区
汤森路透每年出版一本《期刊引用报告》（Journal Citation Reports，简称JCR）。JCR对86000多种SCI期刊的影响因子（Impact Factor）等指数加以统计。JCR将收录期刊分为176个不同学科类别。每个学科分类按照期刊的影响因子高低，平均分为Q1、Q2、Q3和Q4四个区：各学科分类中影响因子前25%(含25%)期刊划分为Q1区，前25%～50% (含50%)为Q2区，前50%～75% (含75% )为Q3区， 75%之后的为Q4区。汤森路透分区中期刊的数量是均匀分为四个部分。
1.2 中科院分区
中科院首先将JCR中所有期刊分为数学、物理、化学、生物、地学、天文、工程技术、医学、环境科学、农林科学、社会科学、管理科学及综合性期刊13 大类。然后，将13大类期刊分各自为4 个等级，即4 个区。按照各类期刊影响因子划分，前5% 为该类1 区、6% ～ 20% 为2 区、21% ～ 50% 为3 区，其余的为4 区。显然在中科院的分区中，1区和2区杂志很少，杂志质量相对也高，基本都是本领域的顶级期刊。中科院分区中四个区的期刊数量是从1区到4区呈金字塔状分布。
1.3 汤森路透期刊分区与中科院分区的比较
中科院期刊分区表常用1-4区，且分区前常用大类或者小类，常用说法为某本期刊在大类某学科为某区。而汤森路透期刊分区常用Q1-Q4（Q表示Quartile in Category），即4个等级中所处的位置，常用说法为某本期刊位于某学科的Q几。
两者最大的不同在于分区方法。在中科院期刊分区表中，主要参考3年平均IF作为学术影响力，最终每个分区的期刊累积学术影响力是相同的，各区的期刊数量由高到底呈金字塔式分布；在JCR的Journal Ranking中，主要参考当年IF，最终每个分区的期刊数量是均分的。